灰原哀，一个年仅七岁的小女孩，却具备着令人惊叹的智慧和洞察力。她是一个天才少女，也是着名侦探工藤新一的好友。在她的帮助下，许多复杂的案件得以解决，而今天，她即将面临的是一宗疑似绑架案件。
这宗案件涉及到一位名叫小明的五岁男孩，他是一位可爱而活泼的孩子，是他父母的希望和快乐的来源。然而，他突然在幼儿园下午放学后失踪了。当他的父母得知这个消息后，他们陷入了深深的绝望之中。他们报了警，但警方一时也没找到任何线索。
与此同时，工藤新一和灰原哀正在进行一次侦破行动。他们偶然听说了小明的失踪，并决定亲自来调查这个案件。他们来到小明家，与他父母进行了交谈，了解到小明在失踪前并没有收到任何威胁信件或不寻常的联系。
灰原哀细心地观察着小明家，她留意到了一些细微的痕迹，这些痕迹可能是绑匪留下的线索。她注意到门把手上有一些灰尘，这表明有人曾经在这里停留。此外，她还发现了一些脚印，这些脚印并不是小明家人的。这些线索给了灰原哀一个方向，她决定跟随这些线索进行进一步的调查。
灰原哀和工藤新一走访了小明家附近的居民，询问是否有人看到过任何可疑的人或车辆。最终，他们找到了几个目击者，他们看到有一辆黑色轿车停在小明家附近。这使得灰原哀更加确信，小明很可能是被绑架了。
灰原哀开始分析案件的细节，她推测绑架者可能是以一种非常巧妙的方式行动的，这样他们才能在短时间内将小明带走，而且不留下太多痕迹。她认为，绑匪可能使用了一种特殊的药物，使小明昏迷，从而更容易控制他。
为了验证她的猜测，灰原哀进行了一系列的实验。她从化学实验室中找到了合适的物质，并将其应用到一个小白鼠身上。果然，小白鼠很快就昏迷了。这个实验结果证明了她的猜测，也为案件的解决提供了重要的线索。
灰原哀和工藤新一再次回到小明家，他们开始仔细检查小明的房间。在床底下，他们找到了一个被遗忘的玩具，这个玩具上有一些模糊的指纹。灰原哀立即将这些指纹采集下来，希望能通过指纹比对找出绑匪的身份。
指纹比对结果显示，这些指纹属于一位已知的罪犯，名叫约翰。他是一个职业罪犯，专门从事绑架案件。工藤新一立即将这一消息告诉了警方，并提供了对约翰进行逮捕的关键线索。
几天后，警方在一座废弃的仓库里逮捕了约翰。在仓库内，他们找到了小明，他虽然有些虚弱，但幸好没有受到严重的伤害。小明的父母欣喜若狂，他们感谢工藤新一和灰原哀的帮助，他们的孩子终于平安回家了。
这宗疑似绑架案件的成功解决不仅归功于警方的努力，更得益于灰原哀的智慧和坚持。她的故事在当地传为佳话，人们赞美她的聪明才智，也对她的勇气和决心表示敬佩。灰原哀成为了一个小小侦探，为正义而战的榜样，她的故事将被后人铭记。